Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Higd1cQ76I25 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms