Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnih3Q6ZWS4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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