Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift172Q6VH22 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift172Q6VH22 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms