Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mfsd4aQ6PDC8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mfsd4aQ6PDC8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms