Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RgmaQ6PCX7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RgmaQ6PCX7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms