Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krt40Q6IFX3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krt40Q6IFX3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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