Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Arhgap20Q6IFT4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms