Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2aa1Q6GSS7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms