Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lemd2Q6DVA0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lemd2Q6DVA0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms