Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smarca2Q6DIC0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smarca2Q6DIC0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms