Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzrn3Q69ZS0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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