Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim24Q64127 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim24Q64127 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms