Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Col4a5Q63ZW6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Col4a5Q63ZW6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms