Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Hoxa13Q62424 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Hoxa13Q62424 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Hoxa13Q62424 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Hoxa13Q62424 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa13Q62424 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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