Protein–RNA interactions for Protein: Q62417

Sorbs1, Sorbin and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs1Q62417 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs1Q62417 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs1Q62417 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sorbs1Q62417 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sorbs1Q62417 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms