Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SrmsQ62270 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SrmsQ62270 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SrmsQ62270 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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SrmsQ62270 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrmsQ62270 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms