Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sall3Q62255 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sall3Q62255 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms