Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PtprrQ62132 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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PtprrQ62132 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms