Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Npm1Q61937 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Npm1Q61937 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms