Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad21Q61550 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad21Q61550 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms