Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd55Q61475 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd55Q61475 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms