Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Acvr1bQ61271 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Acvr1bQ61271 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms