Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klf3Q60980 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms