Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbbp4Q60972 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms