Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2dQ60773 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms