Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn2cQ60772 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms