Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnk2a1Q60737 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk2a1Q60737 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms