Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SkiQ60698 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SkiQ60698 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms