Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sik1Q60670 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sik1Q60670 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sik1Q60670 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sik1Q60670 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sik1Q60670 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sik1Q60670 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sik1Q60670 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sik1Q60670 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sik1Q60670 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sik1Q60670 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sik1Q60670 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sik1Q60670 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sik1Q60670 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sik1Q60670 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms