Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scaf1Q5U4C3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms