Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms