Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med13Q5SWW4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms