Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tsr1Q5SWD9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsr1Q5SWD9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms