Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Sco1Q5SUC9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sco1Q5SUC9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms