Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d1Q5SSN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms