Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PfplQ5RKV8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PfplQ5RKV8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms