Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rtp3Q5QGU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rtp3Q5QGU6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms