Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Trim41Q5NCC3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim41Q5NCC3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms