Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Nlrc3Q5DU56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrc3Q5DU56 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms