Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CenpjQ569L8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms