Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccnl1Q52KE7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnl1Q52KE7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms