Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdp2Q504M2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdp2Q504M2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdp2Q504M2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pdp2Q504M2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdp2Q504M2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pdp2Q504M2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdp2Q504M2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdp2Q504M2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdp2Q504M2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdp2Q504M2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdp2Q504M2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdp2Q504M2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdp2Q504M2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdp2Q504M2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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