Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc84Q4VA36 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms