Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxn3Q499D0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxn3Q499D0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms