Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Krt35Q497I4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt35Q497I4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms