Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ulk4Q3V129 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ulk4Q3V129 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms