Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc185Q3V118 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc185Q3V118 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms