Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed1Q3V009 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms