Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc160Q3UYG1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc160Q3UYG1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms