Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BB287469Q3UT53 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms